集装箱环氧富锌底漆防腐机理是利用电化学的阴极保护作用。富锌底漆中的锌粉含量高，在其干膜中，锌粉颗粒之间、锌粉颗粒与集装箱钢制基材之间是相互接触的。富锌底漆涂膜受到侵蚀时，锌粉作为阳极首先受到腐蚀，底材钢铁作为阴极受到保护；同时锌作为牺牲阳极形成的氧化产物可以对富锌底漆涂层起到封闭作用，加强富锌底漆涂层对底材的保护。富锌底漆中的锌粉在保护过程中逐渐被消耗，但速度很慢。其腐蚀产物的形成，使富锌底漆涂层与底材的电位差减小，当涂膜被损伤时，又露出新的金属锌，电位差立即增大，产生较强的阴极保护作用，所以环氧富锌底漆的锈蚀不会从损伤处向周围扩散。锌粉在自然环境中的腐蚀化学反应过程如下 :

    由上述的环氧富锌底漆的防腐机理可以看出，在锌粉发挥防腐作用的过程中会有碱性的物质产生，所以做为环氧富锌底漆的成膜物质必须有良好的抗皂化能力，否则会由于锌粉漆的牺牲阳极反应，使成膜物质发生化学反应而脱落。一般选用环氧树脂做为成膜物质。
        PVC 是干膜中的颜料体积百分比 , 当 PVC 增加时许多涂膜的性能会发生突然变化，此时的 PVC 是 CPVC （临界颜料体积百分比），即刚好有足够的成膜物质提供颜料表面一个完整的吸附层并填满紧密堆积体系中颗粒间隙的 PVC 。当 PVC低于 CPVC 时，颜料颗粒没有紧密堆积，并且成膜物质占据了过量的体积；当 PVC 高于 CPVC 时，颜料颗粒紧密堆积，成膜物质不足以填满颜料间的空隙。
    由环氧富锌底漆的防腐机理可以看出，当环氧富锌底漆涂膜中的锌粉离子紧密接触时，涂膜具有极好的导电性，当环氧富锌底漆涂膜受到破坏时可以保证良好的牺牲阳极保护的电流回路，充分地发挥环氧富锌底漆的电化学保护作用。因此为了充分体现出富锌涂料的保护作用，环氧富锌底漆的 PVC 必须大于 CPVC 。